現場通關口岸或區(qū)域性海關的核驗關員根據通關管理中心的審結提示，核實辦理書面報關單證的有關手續(xù)，且對每一份進出口單證和原始隨附單證進行審核。對重點、疑難商品可提出并在系統(tǒng)設定查驗需求，轉查驗環(huán)節(jié)處理。
1、企業(yè)遞交書面單證報關
企業(yè)在收到審單處電子審核完畢的回執(zhí)后，及時打印書面報關單，進口需打印二份（加工貿易一式三份），出口需打印三份（加工貿易一式四份），并隨附發(fā)票、裝箱單、合同、海運提單（場站收據）及所需各類許可證件等單證，向現場海關接單窗口辦理手續(xù)。
2、通關順序
接單海關接受報關企業(yè)遞交的書面報關單證。經審核對非應稅和查驗（化驗）的正常報關單，即刻流轉到海關放行環(huán)節(jié)。
A.查驗查驗是指海關在接受報關單位的申報并以已經審核的申報單證為依據，通過對進出口貨物進行實際的核查，以確定其報關單證申報的內容是否與實際進出口的貨物相符的一種監(jiān)管方式。海關查驗貨物，一般在海關監(jiān)管區(qū)內的進出口口岸碼頭、車站、機場、郵局或海關的其他監(jiān)管場所進行。
B.稅費等手續(xù)的處理征收稅費等各種書面單證手續(xù)的辦理由口岸海關負責。如打印發(fā)送稅費憑證；核準核銷許可證件、加工貿易手冊、減免稅證明；辦理稅款繳庫核準手續(xù)；檢查上述單證的真?zhèn)蔚?。海關對已繳納稅費的報關單（憑銀行或有關部門加蓋收訖章的稅費繳納證回執(zhí)聯）在辦理稅費核銷手續(xù)后即刻流轉到放行環(huán)節(jié)。
C.放行對上述三個環(huán)節(jié)的電子報關數據和書面報關單證及批注情況進行復核，情況正常的，辦理實物放行手續(xù)。